Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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Col5a3Q9JLI2 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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