Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms