Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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