Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Gm2056J3QQ02 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Gm2056J3QQ02 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms