Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vipas39Q8BGQ1 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Vipas39Q8BGQ1 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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