Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PtpreP49446 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PtpreP49446 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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