Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ArxO35085 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ArxO35085 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms