Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smg9Q9DB90 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms