Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms