Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col5a3Q9JLI2 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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