Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms