Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PtprmP28828 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PtprmP28828 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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