Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd11P23813 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms