Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Hoxb1P17919 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Hoxb1P17919 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxb1P17919 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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