Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CtcflA2APF3 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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