Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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