Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccdc18Q640L5 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc18Q640L5 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms