Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VdrP48281 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VdrP48281 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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VdrP48281 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
VdrP48281 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
VdrP48281 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
VdrP48281 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
VdrP48281 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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