Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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