Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb1P17919 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms