Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Gm3250E9Q1M3 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms