Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Riok3Q9DBU3 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms