Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NischQ80TM9 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NischQ80TM9 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NischQ80TM9 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms