Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtpreP49446 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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