Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd10P28359 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms