Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd11P23813 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hoxd11P23813 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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