Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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Ccl20O89093 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccl20O89093 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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