Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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