Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Crlf3Q9Z2L7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Crlf3Q9Z2L7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms