Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk1bQ9Z2C6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk1bQ9Z2C6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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