Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tulp1Q9Z273 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tulp1Q9Z273 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms