Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn6Q9Z262 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms