Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clic1Q9Z1Q5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms