Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4s1Q9WVL1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms