Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slit3Q9WVB4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slit3Q9WVB4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slit3Q9WVB4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms