Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VapaQ9WV55 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapaQ9WV55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms