Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabbr1Q9WV18 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabbr1Q9WV18 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms