Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms