Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13bQ9WU72 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms