Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scnn1bQ9WU38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scnn1bQ9WU38 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms