Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrf1Q9WU00 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrf1Q9WU00 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms