Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkraQ9WTX2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms