Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam50bQ9WTJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms