Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed2Q9R0Q3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms