Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrpxQ9R0M3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrpxQ9R0M3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms