Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zeb2Q9R0G7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms