Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod1Q9R0E2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms