Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod3Q9R0E1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms