Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcf1Q9QZM3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms