Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmlQ9QZD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms